Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF4P15884 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF4P15884 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF4P15884 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF4P15884 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF4P15884 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF4P15884 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF4P15884 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF4P15884 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF4P15884 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF4P15884 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF4P15884 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF4P15884 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF4P15884 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF4P15884 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF4P15884 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF4P15884 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF4P15884 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF4P15884 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF4P15884 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF4P15884 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF4P15884 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF4P15884 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF4P15884 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF4P15884 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF4P15884 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF4P15884 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF4P15884 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF4P15884 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF4P15884 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF4P15884 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF4P15884 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF4P15884 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF4P15884 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF4P15884 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCF4P15884 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF4P15884 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF4P15884 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF4P15884 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF4P15884 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF4P15884 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF4P15884 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF4P15884 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF4P15884 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms