Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CYSRT1A8MQ03 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYSRT1A8MQ03 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms