Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms