Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2IRD1Q9UHL9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms