Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms