Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms