Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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