Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms