Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms