Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms