Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms