Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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