Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms