Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms