Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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