Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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