Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms