Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms