Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms