Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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TWF1Q12792 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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