Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms