Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINC00566-201ENST00000561557 570 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MRPL47-203ENST00000476781 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 NPHP1-205ENST00000418527 742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC079385.2-201ENST00000547531 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 VPS4B-207ENST00000591519 551 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC009120.6-201ENST00000616116 1460 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL117382.1-201ENST00000438702 754 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SGO1-210ENST00000443724 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RASA2-IT1-201ENST00000507770 612 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms