Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms