Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms