Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC26A5P58743 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms