Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSEN1P49768 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms