Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms