Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms