Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms