Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms