Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCF2P10911 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms