Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIGD3P0DMS9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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