Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTCP00480 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTCP00480 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTCP00480 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTCP00480 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTCP00480 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTCP00480 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms