Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms