Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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