Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms