Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms