Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms