Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms