Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms