Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
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