Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms