Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms