Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms