Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms