Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM175Q9BSA9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM175Q9BSA9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms