Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms