Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD1Q8NHV4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms