Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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FAM71DQ8N9W8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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