Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms